基于转录组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉高压啮齿类动物模型的新靶点

肠胃动脉高热（PH）是同义静息时平均肠胃动脉压≥25 mmHg。 它根据血流动力研习外观上、患病必要和解剖研习细分五类。 第三类高纬度肠胃动脉高热（HAPH）是由于在高纬度肠胃部生态中的肠胃换气用量代偿连续性增加和肠胃小动脉血管收缩造成的，致使平原心肌病。 临床患者包括运动连续性晕眩、恶心和疲劳。 HAPH 显然反映了未能适应高纬度，并伴有不清楚的解剖生理必要。 大约有 1.4 亿人生活在海拔 2,500 米以上的邻近地区，每年有超过 4,000 500人回访这些高纬度邻近地区。 肠胃部致使人体器官基因传达谱发生差异性变异； 这是从仍然居住在高纬度邻近地区的居民及其后代的遗传基因适应连续性变异中的得知的。HAPH 的化疗仍在科学研究中的。应促请患者移往低海拔邻近地区，氧疗有效。类固醇化疗的科学研究局限一些随机试验。 HAPH 的解剖与其他类型的 PH 常为似，因此值得考虑对 PAH 有效的类固醇是否对 HAPH 有效。

然而，所有这些类似物类固醇都在HAPH中的的有效连续性和必要尚为不清楚。为了解决这个问题，我们旨在科学研究肠胃部所关乎的原子必要，用作毒素 HAPH 模型，并应用综合多组研习方式。 在此步骤中的，我们旨在科学研究几种类似物类固醇和复氧的作用，以确认高纬度造成的肠胃部的潜在新化疗抗肿瘤。 特别是，我们科学研究了类似物类固醇如何制约人体器官密切关系的差异性基因和酵素传达。

科学研究所设计：

将毒素置于 10% O2（肠胃部）室中的 3 周以产生 PH。依此毒素（C 组）在整个科学实验中的都处于常氧生态下，并在化疗期间（即从第 21 天开始）用载体完成化疗。 3由此可知，其余毒素随机细分六组；组合成被处死（第 21 天）以审核心肠胃功能性。其余 5 组用类似物类固醇或复氧化疗，从第 21 天到第 35 天处死。慢连续性肠胃部，载体检视（M）；慢连续性肠胃部，司来帕格化疗；慢连续性肠胃部，奈斯替坦化疗；慢连续性肠胃部，riociguat 化疗；慢连续性肠胃部、复氧 (RE)。

转录组深入科学研究：

提取总 RNA，并通过用作 Arraystar rRNA Removal Kit 去除 rRNA 来可溶性 mRNA 和非编码 RNA。 mRNA 和非编码 RNA 被片段化缓冲液分解片段段（~200-500 nt）。以片段段为常用量，利用随机六聚体引物裂解第一链cDNA。在第二链裂解步骤中的，dTTP 被 dUTP 代替。 然后加入洗脱缓冲液以通过末端修复和添加鸟嘌呤来化学合成和复合片段段。 片段段被化学合成并与电源线通到； 用作尿嘧啶-N-过氧化物酶消化第二条链。 琼脂糖凝胶电泳后，必需合适的片段作为常用量完成PCR缩减。 用作 Agilent 2100 动物深入科学研究仪和 ABI StepOnePlus 可视 PCR 系统对对探头库完成定用量和质用量审核。 该文库用作 Illumina HiSeq 2000 系统对完成测序。

LC-MS/MS 深入科学研究

在通到到 Easy-nLC 1000 毛细管色谱法系统对的Q Exactive HF 质谱仪上深入科学研究探头。将干燥的抑制剂探头原先结晶在溶剂 A（0.1% 甲酸水溶液）中的并加载到捕集柱中的用作溶剂 A 的最大负荷为 280 bar，然后在全套的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的梯度完成复合流动常为 B（苯甲酸和 0.1% 甲酸），流速为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 深入科学研究是在 3e6 离子的自动增益控制目标下完成一次全照常为，然后完成总共 30 次与数据库方面的 MS/MS 照常为不具备更高能用量的交互作用解离，在 Orbitrap 中的检测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

科学研究结果：

基于RNA-seq数据库的共传达网路的功能性可溶性深入科学研究和交汇点原子鉴别。

基于酵素数据库的共传达网路的功能性可溶性深入科学研究和交汇点原子鉴别。

RNA-seq 和酵素组研习揭示了对三种类固醇的质子化密切关系的强方面连续性，不具备基本上常为同的效果。GO 可溶性显示差异性传达的基因包括加入代谢调节、转录和译者的基因。

司来帕格、奈斯替坦和复氧可改善 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被鉴别出来，通过多组研习筛选，作为加入HAPH的关键因素基因。这些注意到为 HAPH 的类似物类固醇必要提供了在此之后论点。

科学研究事实：

Selexipag、macitentan 和复氧显着消退了毒素 HAPH 模型，而 riociguat 的作用占优势。 差异性传达的基因加入代谢管控、转录和译者。 某些酵素受到 HAPH 和化疗的制约。 我们用作多组研习方式筛选了关键因素基因 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些注意到显然有助于更好地了解肠胃部所关乎的原子必要，并显然提供在此之后化疗抗肿瘤。

文献原文：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.